Cómo ver imagenes de una tomografía



A quién se le ocurre hacer un post así! bueno, seguramente a todo nerd que alguna vez tuvo que hacerse una tomografía computada y le entregaron como resultado una impresión tipo radiografía pero también un CD. Y eso me pasó el otro día.

No, tranquilos, no tengo nada raro, el otorrinolaringólogo decidió que entre meterme algo en la nariz y que me bombardeen rayos X era más cómodo lo último así que me dio la orden y me tomaron una linda tomografía del cráneo, como para ver si respiro bien o me asfixiaré de tanta boludez.

El tema es que me entregaron los resultados, los cuales difícilmente entienda por la terminología donde hasta cuando estás bien parece que te vas a morir mañana, y entre los papeles un lindo CD, ahí me encontré con los archivos DICOM. Pero ¿Cómo cuernos los leo?





Para empezar tenía que buscar algo para Linux porque el único lector de CD que tenía contectado era el de la notebook, así que me dispuse a buscar qué había y por suerte di con varios.

El problema es que no todos los programas abrieron los archivos hasta que empecé a lograrlo, muchas veces por error mío otras por falta de testeo de las aplicaciones en Linux así que pasé a Windows para poder ver si realmente era el soft, pude corroborar que efectivamente le falta mucho testeo a algunos, pero, pude!

Las imagenes estan en formato DICOM que es mucho más complejo y lleno de metadata que cualquier otra imagen, además es todo un protocolo de red, pero aquí tenía los archivos en CD así que no hacía falta inventar nada raro.

Desde ya que busqué software gratuito pero principalmente libre y me sorprendí con las buenas cosas que encontré en este ámbito...

MicroDICOM



Empecemos con los "pequeños", este es sólo para Windows pero te permite ver todas las vistas más las dos capas de referencia y no mucho más, es para verlo bien en pantalla grande y tiene algo genial, poder exportar un pequeño video con todos los slices



Sitio oficial

GinkGo



Este no funcionaba para Linux porque no tenía soporte para Ubuntu 16.04 pero en Windows funciona sin problemas y pude obtener algo muy parecido al MicroDICOM



Sitio oficial

Invesalius



Este soft brasileño no funcionó en Linux, no puede abrir los archivos, pero apenas pude abrir los archivos en Windows me demostró ser genial, es un proyecto muy bueno con mucho futuro, genera un render 3D a partir de los slices que tiene, se puede cambiar la parametrización para que muestre tejidos blandos, hueso, distintas gamas, es realmente de lo mejor que vi.





Sitio oficial

Slicer 3D



El Slicer fue el que mejor me funcionó en Linux, así como viene funciona sin problemas, el único problema es que, a diferencia de Invesalius, no me generaba el render 3D sin un modelo 3D que obviamente ni idea cómo obtener ni generar.





Sitio oficial

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Comentarios

  • Virginia    

    Jaja me hizo reir primero el post y luego me dio intriga.
    Hace 10 me hice la primera tomografia y el italiano te daba el cd con un ejecutable para leerlas y las placas a la antigua. Por suerte se modernizaron y ahora las leo directo de la web.
    Pero alucine que ibas a explicar como leer las imagenes jajaja
    Me sigo haciendo TC aun hoy de cerebro, macizo facial, cuello torax y abdomen y sigo sin entender lo que tengo pero las veo barbaro desde la web jaja

    Igual voy a probar algunos de los que subiste a ver que onda. De nardelli mas jaja

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  • Sebastian    

    En la primera foto sale tu DNI y fecha de nacimiento.

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  • Ignacio    

    yo me hice 2 del corazón y en el cd venía un auto ejecutable....

    no hay nada como compartir tu corazón en las redes...
    https://www.instagram.com/p/BD5jrEdFOV5/

    voy a probar lo del render 3d, gracias!!

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  • Sebastian dijo:

    En la primera foto sale tu DNI y fecha de nacimiento.


    si, los cuales son recontra públicos desde hace rato :/

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  • Ahora busca como exportarlo a STL y lo imprimimos en 3d!

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  • En la segunda foto sale tu clave fiscal nivel 3

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  • pitufo+loco dijo:

    En la segunda foto sale tu clave fiscal nivel 3


    es nivel 4, por eso la tengo escrita en el cráneo con láser, nuevo requerimiento de la AFIP :P

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  • Fabio Baccaglioni dijo:

    Sebastian dijo:
    En la primera foto sale tu DNI y fecha de nacimiento.


    si, los cuales son recontra públicos desde hace rato :/


    Todos sabemos que la fecha de cumpleaños es incorrecta. Don Fabio nació en una fecha patria.

    Ahora quiero una TC yo tambien... Voy a tener que inventarme alguna dolencia e ir al tordo

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  • Cattel    

    Con mi experiencia en Dr. House así a vuelo de pájaro te puedo decir que no es Lupus.

    Ahora bien, por qué no se copan y te graban en el CD algo para verlo? Si no que te regalen un apoya vasos y listo.
    A ver si encuentro en algún lado alguna ecografía de bebé para probar estos cosos.

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  • Cattel dijo:

    Con mi experiencia en Dr. House así a vuelo de pájaro te puedo decir que no es Lupus.

    Ahora bien, por qué no se copan y te graban en el CD algo para verlo? Si no que te regalen un apoya vasos y listo.
    A ver si encuentro en algún lado alguna ecografía de bebé para probar estos cosos.


    trae un viewer pero es re básico y en JAVA y trato de NO usar java :P

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  • Demon    

    Muy copada tu nota, el slicer lo uso para generar el gcode para imprimir con la 3d, capaz que si generas ese archivo o lo podes pasar a stl, el soft repetier lo pueda leer...

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  • Demon dijo:

    Muy copada tu nota, el slicer lo uso para generar el gcode para imprimir con la 3d, capaz que si generas ese archivo o lo podes pasar a stl, el soft repetier lo pueda leer...


    si, de hecho vi que varios médicos utilizan el scan para imprimir en 3D los tejidos del paciente antes de una operación, poder separar cada cosa, imprimirlas en distintos colores, etc.

    no lo haría, claro, con este soft sin validar, pero sé que se estila bastante, viendo lo que produce un buen scan, obviamente es increíble

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  • nacho    

    Despues de esto van a saltar los defensores del pinguino (del vivo, no del otro), pero que solo hayas podido hacerlo andar en 1 de todas las aplicaciones bajo linux y sin soporte 3D, demuestra lo lejos que esta linux de ser un sistema de escritorio para el comun de los mortales.
    No discuto su potencia como software de servidor, y laburo, pero en cuanto a escritorio para que lo use doña rosa, le falta bastante...

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  • Leo    

    nacho dijo:

    Despues de esto van a saltar los defensores del pinguino (del vivo, no del otro), pero que solo hayas podido hacerlo andar en 1 de todas las aplicaciones bajo linux y sin soporte 3D, demuestra lo lejos que esta linux de ser un sistema de escritorio para el comun de los mortales.
    No discuto su potencia como software de servidor, y laburo, pero en cuanto a escritorio para que lo use doña rosa, le falta bastante...



    Doña Rosa usa el SO del pinguino hace rato. A mi vieja (+60), mi tia (84 años) y mi cuñada (maestra de primario) les instale linux mint y les parecio mas facil de usar. Cuando les dije que podian meter cualquier pendrive infectado y no preocuparse no lo podian creer. En el trabajo nos cayo la gente de software legal y se fueron a los dos minutos, todas las PCs tienen linux tambien.
    Contras del escritorio de linux no hace tanto? No andaba netflix, instalar un driver propietario era un parto, compatibilidad con office, codecs propietarios, fuentes, falta de IE6... ya se soluciono todo.

    Puede ser bastante complicado ver tomografias en linux, pero mas dificil es lidiar todos los dias con virus, navegadores infectados, toolbars y popups, EULAS inentendibles, rootkits, demos de norton antivirus preinstalados, keys de activacion, redes que cuando no funcionan a la primera abren el "solucionador de problemas", rezar para que no pase nada si el AV detecta una "amenaza", discos rigidos a full durante horas cuando no estas usando la pc para nada (?), un registro criptico y si sos medio rata complicartela mas con activadores, cracks, seriales, downloads de paginas rusas, etc.
    El ultimo windows que vi era un win 10 que duro 15 minutos, mientras trataba de entender porque tenia la pantalla tan llena de sugerencias de skype, office y McAfee (jajaja), un menu inicio poco practico y como hacia para ocupar mas de 20Gb sin tener ni siquiera un word o excel instalado.

    El comentario del quote igual es valido... en el 2004.
    Saludos.

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  • Daniela    

    yo tengo mac, en el hospital me dieron un cd que tengo que mostrarle a otro medico y no puedo ver las imagenes

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